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发过Nature文章的大咖一周内教您学会挖掘单细胞测序公共数据库来发表文章
2021/2/1 17:42:43

本课程具体内容安排请下拉▼其他班课程详情请点击

1.30-31

线上

请点击:如何将中药网络药理学和分子对接结合发表高分论文

1.23-24

线上

请点击:2021年基金标书撰写专家指导和学员经验分享会

1.23-24

线上

请点击R语言挖掘公共数据库(TCGA、GEO)发表文章

1.30-31

线上

请点击:从蛋白质组到蛋白质功能技术与应用

1.16-17

线上

请点击:2天让您学会影像组学应用与SCI论文写作

1.18-22

线上

请点击:DNA及RNA甲基化数据分析、课题设计与基金写作

1.23-24

线上

请点击:SCI论文插图、机制模式图绘制专题班(课后提供作图服务)

1.23-24

线上

请点击:肠道菌与代谢课题设计思路、实验数据分析(含中医药基金写作)

1.30-31

线上

请点击:磁共振脑影像数据处理基础班

1.25-29

线上

请点击:单细胞测序数据挖掘与课题设计与基金写作

1.30-31

线上

请点击:CRISPR/Cas9基因组编辑技术(免费赠送对照质粒和速制备试剂盒

1.30-31

线上

请点击:Meta分析与网状meta分析(免费提供所有数据、代码)

1.30-31

线上

请点击:科研数据处理、统计分析与图表制作专题学习线上班

1.30-31

线上

请点击:不做实验不写meta分析如何快速发文章(临床预测模型)




面向人群


广大临床/科研工作者,硕、博研究生,零基础也可以参加。



课程背景

单细胞测序技术作为科研领域最新、最热的技术,发展神速。好的技术给科研带来了更为丰富、精准的数据。如何在最终的数据分析中结合生物学背景挖掘到更多信息也是困扰很多科研人员的一大难题。为了让更多的研究者了解单细胞测序数据挖掘的常用套路以及单细胞常用数据分析软件的使用特举办单细胞测序数据挖掘与课题设计学习班。



授课老师

来自中科院,长期从事单细胞多组学方面的项目研究,发表Nature等杂志四十多篇论文,目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。









学习目标

1、了解单细胞测序基本概念及原理

2、了解单细胞测序分析的常用软件

3、掌握单细胞测序数据的下载方法

4、掌握单细胞测序数据的研究思路

5、学会R语言基本语法和绘图技巧

6、学会用R代码进行单细胞转录组分析并作图

7、熟悉CNS杂志单细胞转录组文章思路

8、熟悉零成本的单细胞相关课题设计思路

9、获得全套全自动化分析单细胞数据的流程脚本




课程安排




第一天晚上

7:00-

10:30

单细胞测序技术与应用

1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍

2. 单细胞测序技术在科研领域的应用

3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析

4. 单细胞文章常见图表解读

5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及植物等领域的研究内容及思路

理论

晚上

7:00-

10:30

LinuxR语言入门实操

1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练

2. R语言简介及安装,RStudio的安装及使用说明。

3. R语言语法介绍及常用命令

4. 数据处理功能及统计应用

5. R语言画图实操tSNE,小提琴图,热图,网络图,GOKEGG富集图,GSEA等图形绘制

实操

晚上

7:00-

10:30

单细胞转录组数据分析思路及流程

1. 单细胞高分文章分析思路解析(细胞类群确定拟时间分析差异表达、通路富集转录因子、配体受体互作等

2. 单细胞转录组比对定量分群及拟时间分析等软件及参数

3. 单细胞转录组转录因子功能通路配体受体互作思路解析

4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。

5. 基因富集分析和可视化

理论

晚上

7:00-

10:30

单细胞数据可视化、细胞分型及marker鉴定

1. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操

2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操

3. 通过Seurat软件进行PCAtSNE降维

4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析

5. 通过SeuratGSVA等进行单细胞转录组差异分析

实操

晚上

7:00-

10:30

单细胞数据轨迹分析,功能富集




 

单细胞基金写作

1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析

2. 通过DAVIDmetascape网站进行通路富集分析

3. 单细胞数据分析总结

4. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路

5. 单细胞测序基金申请思路

6. 单细胞测序基金申请前期准备

7单细胞测序基金申报常见问题分析与应对

8. 如何撰写单细胞基金课题申请书

理论+

实操






【主办单位】

玮瑜科研平台

【承办单位】

上海玮瑜生物科技有限公司

上海焦务科技服务中心

【注册费用】



单独参加(单独参加本班):3200元/人      

 两班连报(任选其他一个班):6000元/人(其他班见首页)    

可开会务费 注册费 检测费  分析服务费等发票


【时间地点】

会务时间:2021年1月25日-29日   线上班

【联系人】


联系人:吴老师15618236948

报名邮箱: info@shanshuyuan.com