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发过Nature文章的大咖一周内教您学会挖掘单细胞测序公共数据库来发表文章
2021/2/24 17:25:22

发过Nature文章的大咖一周内教您学会挖掘单细胞测序公共数据库来发表文章3月15-19日

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2.14和21

线上

国自然基金提交前专家审查把关和一对一辅导会

2.27-28

线上

影像组学应用与SCI论文写作线上班

2.27-28

线上

蛋白质组学技术与应用线上培训线上培训

3.6-7

线上

中医中药如何挖掘数据发文章及中药复方如何发高分文章

3.6-7

线上

R语言挖掘公共数据库（TCGA、GEO）发表文章

3.6-7

线上

多模态脑影像数据的处理与分析培训班

3.13-14

线上

Meta分析与网状meta分析（免费提供所有数据、代码）

3.13-14

线上

SCI论文插图、机制模式图绘制专题班（课后提供作图服务）

3.13-14

线上

如何利用老师提供的R语言代码和数据快速发表SCI文章

3.15-19

线上

一周内教您学会单细胞测序数据挖掘与课题设计

3.20-21

线上

不做实验不写meta分析如何快速发文章（临床预测模型类论文）

3.20-21

线上

（从有数据到发文章一条龙培训）数据处理、统计分析与图表制作

3.27-28

线上

肠道菌与代谢课题设计思路、实验数据分析


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面向人群


广大临床/科研工作者，硕、博研究生，零基础也可以参加。


①

课程背景

单细胞测序技术作为科研领域最新、最热的技术,发展神速。好的技术给科研带来了更为丰富、精准的数据。如何在最终的数据分析中结合生物学背景挖掘到更多信息也是困扰很多科研人员的一大难题。为了让更多的研究者了解单细胞测序数据挖掘的常用套路以及单细胞常用数据分析软件的使用特举办单细胞测序数据挖掘与课题设计学习班。



②

授课老师

来自中科院，长期从事单细胞多组学方面的项目研究，发表Nature等杂志四十多篇论文，目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。


③

学习目标

1、了解单细胞测序基本概念及原理

2、了解单细胞测序分析的常用软件

3、掌握单细胞测序数据的下载方法

4、掌握单细胞测序数据的研究思路

5、学会R语言基本语法和绘图技巧

6、学会用R代码进行单细胞转录组分析并作图

7、熟悉CNS杂志单细胞转录组文章思路

8、熟悉零成本的单细胞相关课题设计思路

9、获得全套全自动化分析单细胞数据的流程脚本


④

课程安排


第一天晚上

7:00-

10:30

单细胞测序技术与应用

1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍

2. 单细胞测序技术在科研领域的应用

3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析

4. 单细胞文章常见图表解读

5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物等领域的研究内容及思路

理论

第二天晚上

7:00-

10:30

Linux及R语言入门与实操

1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练

2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。

3. R语言语法介绍及常用命令

4. 数据处理功能及统计应用

5. R语言画图实操：tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制

实操

第三天晚上

7:00-

10:30

单细胞转录组数据分析思路及流程

1. 单细胞高分文章分析思路解析（细胞类群确定、拟时间分析、差异表达、通路富集、转录因子、配体受体互作等）

2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等软件及参数

3. 单细胞转录组转录因子、功能通路及配体受体互作思路解析

4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。

5. 基因富集分析和可视化

理论

第四天晚上

7:00-

10:30

单细胞数据可视化、细胞分型及marker鉴定

1. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操

2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操

3. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维

4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析

5. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析

实操

第五天晚上

7:00-

10:30

单细胞数据轨迹分析，功能富集




 

单细胞基金写作

1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析

2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析

3. 单细胞数据分析总结

4. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路

5. 单细胞测序基金申请思路

6. 单细胞测序基金申请前期准备

7. 单细胞测序基金申报常见问题分析与应对

8. 如何撰写单细胞基金课题申请书

理论+

实操

【注册费用】

单独参加（单独参加本班）：3200元/人      

两班连报（任选其他一个班）：6000元/人（其他班见首页）    

可开会务费 注册费 检测费  分析服务费等发票

两人同时报名，每人可享优惠200元

三人同时报名，每人可享优惠300元

四人同时报名，每人可享优惠400元

优惠多多，以此类推，上不封顶。

【时间地点】

会务时间：2021年3月15日-19日   线上班

【联系人】

联系人：吴老师 15618236948

报名邮箱： info@shanshuyuan.com

【报名方法】

报名方法一：邮箱报名：您编辑您的姓名、手机号码 参加班级发送到info@shanshuyuan.com邮箱

报名方法二：联系人：吴老师：15618236948（微信同号）